Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms