Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms