Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms