Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms