Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms