Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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