Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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