Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp27Q8CEG8 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp27Q8CEG8 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp27Q8CEG8 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp27Q8CEG8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp27Q8CEG8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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