Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms