Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms