Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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