Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms