Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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