Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms