Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Samd11Q1RNF8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Samd11Q1RNF8 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Samd11Q1RNF8 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Samd11Q1RNF8 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samd11Q1RNF8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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