Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlh1Q02576 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms