Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms