Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms