Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H3f3aP84244 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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