Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms