Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms