Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtbrP50284 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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