Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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