Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm6028-201ENSMUST00000077111 574 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Olfr1425-201ENSMUST00000087828 939 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Alg13-203ENSMUST00000123710 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm9637-201ENSMUST00000179141 873 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC165159.1-201ENSMUST00000223825 631 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm13178-201ENSMUST00000036876 1227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 C920021L13Rik-202ENSMUST00000142433 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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