Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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