Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms