Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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