Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms