Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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