Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm6880A3KG45 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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