Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms