Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sec16aA2AIX1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms