Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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