Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Higd1aQ9JLR9 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms