Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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