Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms