Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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