Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp16Q99LG0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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