Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Trappc12Q8K2L8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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