Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms