Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms