Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NischQ80TM9 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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