Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Fam50a-201ENSMUST00000114160 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ClmQ7TSN2 Cdk16-202ENSMUST00000115364 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms