Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttbk1Q6PCN3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms