Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
AtminQ6P9S1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms