Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms