Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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