Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gse1Q3U3C9 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gse1Q3U3C9 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms