Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Trim34a-203ENSMUST00000106849 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mapre2-201ENSMUST00000025127 4026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm13592-201ENSMUST00000118148 1010 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms