Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GscQ02591 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GscQ02591 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GscQ02591 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GscQ02591 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GscQ02591 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms